在人的肠道中存在着一些细菌。在正常情况下，这些细菌不致病，它们与人友好相处。但是，如果长期使用抗生素后就会导致“菌群失调”，引起肠炎。
在肠道内存在的细菌叫“常驻菌”，这些细菌参与维生素K的合成。外来进入肠道的细菌称“过路菌”，只是通过肠道，而不再肠道内停留，多被常驻菌杀灭。这些常驻菌可称为肠道的公安战士。
但是，如果长期应用抗生素，可以将肠道的常驻菌消灭。因为抗生素不会分辨那些细菌是″好的″，哪些是″坏的″。特别是有些细菌，如金黄色葡萄球菌、霉菌（也称白色念珠菌）抗药性强，抗生素对他们无能为力，可长驱直入到肠道内。由于常驻菌已经被抗生素消灭了，因此，它们就在肠道里居住下来，生长繁殖，最后引起肠炎，及金黄色葡萄球菌肠炎，或白色念珠菌肠炎。
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